Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms