Protein–RNA interactions for Protein: Q30154

HLA-DRB5, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB5Q30154 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB5Q30154 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms