Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPHKAPQ2M3C7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
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