Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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