Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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