Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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