Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK2Q16620 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK2Q16620 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK2Q16620 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK2Q16620 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK2Q16620 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK2Q16620 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK2Q16620 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK2Q16620 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK2Q16620 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms