Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACKR1Q16570 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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