Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CARTPTQ16568 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms