Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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