Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCEA2Q15560 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
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