Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A1Q15459 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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