Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms