Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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