Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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GBX1Q14549 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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GBX1Q14549 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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GBX1Q14549 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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