Protein–RNA interactions for Protein: Q14432

PDE3A, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase A, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3AQ14432 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3AQ14432 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3AQ14432 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3AQ14432 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3AQ14432 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3AQ14432 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3AQ14432 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3AQ14432 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3AQ14432 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3AQ14432 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3AQ14432 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3AQ14432 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3AQ14432 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3AQ14432 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3AQ14432 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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