Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms