Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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