Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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