Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms