Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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