Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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