Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLEQ07864 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLEQ07864 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLEQ07864 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLEQ07864 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLEQ07864 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLEQ07864 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLEQ07864 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLEQ07864 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms