Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms