Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms