Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms