Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms