Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms