Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO4P61968 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO4P61968 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms