Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UFM1P61960 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms