Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms