Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms