Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP7P55210 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP7P55210 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP7P55210 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP7P55210 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP7P55210 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP7P55210 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP7P55210 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP7P55210 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP7P55210 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP7P55210 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP7P55210 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP7P55210 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP7P55210 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP7P55210 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP7P55210 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP7P55210 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP7P55210 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP7P55210 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms