Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP1P53367 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms