Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms