Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms