Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THOP1P52888 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THOP1P52888 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
THOP1P52888 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
THOP1P52888 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
THOP1P52888 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
THOP1P52888 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
THOP1P52888 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
THOP1P52888 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms