Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEK4P51957 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEK4P51957 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEK4P51957 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK4P51957 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK4P51957 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK4P51957 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms