Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERFP50548 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERFP50548 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms