Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms