Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCAMP43121 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCAMP43121 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCAMP43121 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCAMP43121 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCAMP43121 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCAMP43121 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCAMP43121 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCAMP43121 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCAMP43121 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCAMP43121 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms