Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms