Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMPOP42166 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMPOP42166 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPOP42166 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPOP42166 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPOP42166 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms