Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms