Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms