Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms