Protein–RNA interactions for Protein: P35789

ZNF93, Zinc finger protein 93, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF93P35789 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF93P35789 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms