Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms