Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLIP1P30622 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms