Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms